In "Acient Quest of Saqqarah" geht es darum, Denkaufgaben zu lösen, dafür Punkte zu kassieren und einen neuen Highscore aufzustellen. Die Denkaufgaben sind kurze Puzzelspiele, die stark an Minispiele von Webseiten wie www.miniclip.com erinnern.
Man bekommt ein Raster mit verschieden farbigen Tokens vorgegeben darauf. Nun gilt es, die Tokens auf dem Raster ähnlich wie auf einem Rechenschieber zu bewegen.
Die eher nebensächliche Story erzählt, dass sich unter der Cheops Pyramide eine Oase mit vielen Tempeln befindet. Für jeden Ägyptischen Gott ein Tempel. Die verschiedenen Tempel muss man sich nach und nach freispielen. In jedem Tempel gibt es ein anderes etwas abgeänderte Version des Puzzlespiels. Im ersten muss man die Tokens tauschen und eine Kombination von mindestens drei Tokens legen. Im zweiten Spiel darf man mit den Tokens quer übers Brett hüpfen und im dritten Tempel muss man mit der Maus über drei nebeneinander liegende Steine finden und diese mit der Maus markieren. Wenn man einmal nicht mehr weiter weiß und eine Zeit lange keine Kombination errät, gibt es eine Hilfefunktion, die einem automatisch anzeigt, wo sich eine Kombination aus mindestens drei Steinen verbirgt.
Sollte es keine Kombination mehr geben, kann man die Shuffle-Funktion einsetzen, die die Steine im Raster neu mischt. Diese Shuffle-Funktion ist aber nur beschränkt verfügbar. Damit man das Spiel schnell erlernt, bekommt man Hilfe von einem türkisenen Affen mit Pharaonenmütze. Von Zeit zu Zeit hilft einem der Affe mit Zaubersprüchen.
Leider gibt es von Tempel zu Tempel nur minimale Veränderungen im Spielprinzip, so dass die Motivation weiter zu machen eher gering bleibt. Eine Story ist zwar vorhanden, aber eher nebensächlich, da sie nicht über das auf Dauer eintönige Gameplay hinwegsehen lässt.